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  • 1这篇论文从“全球共享流感数据倡议组织”中提取了160个世界各地的新冠病毒组成了系统进化网络。
  • 2他们发现全球感染人类的病毒可分为ABC三个类群。A群新冠病毒,是在人类社会里传播的最原始的病毒,A型病毒并没有在武汉和中国大范围地出现,更多出现在美国和澳大利亚。B群新冠病毒,被认为是通过A群突变而来,分布以亚洲为主,但是亚洲以外的每个B群都进化出了突变;而C群冠状病毒被认为是B群突变而来,在中国大陆不存在,主要在欧洲分布。
  • 3为何A型病毒并没有在武汉和中国大范围地出现,这可能是因为A型并不适应当地人的免疫系统,所以才变异成了B型,但也可能是因为当地更多的病例是由B型感染者传染出去的,即遗传学上的“奠基者效应”(founder effect)。
  • 4其实,这篇论文本身其实并没有直接回复大家都关心的问题“新冠病毒是起源于美国,还是中国”。据悉,作者已经更新了他们的样本至1000例,但目前尚未通过同行评议发表出来。
  • 5关于病毒的起源,我国的学者也发布过不少论文,剑桥大学这篇研究几乎是在重复我国学者的工作,正如欧美的防疫一步步验证我国已经验证的问题(比如戴口罩、加强隔离等)。

一场新冠病毒疫情,始于2019年年底,结束似乎还遥遥无期,还有愈演愈烈之势。

但是,这次疫情源头是哪儿,一直备受关注。

近日,一项来自剑桥大学遗传学家彼得·福斯特(Peter Forster)博士团队的研究引发热议,他们从新冠患者分离的第一批160个完整基因组序列分析发现,新冠病毒起源可能来自美国和澳大利亚,而不是中国武汉患者。

(剑桥大学新冠病毒进化研究引发争议。来源:剑桥大学官网)

无独有偶。4月10日,国家卫健委高级别专家组成员、中国疾控中心流行病学首席科学家曾光教授接受媒体采访,谈及海外疫情时也表示:“如果(疫情)没有控制住,只能说明两个问题:一是可能除了武汉以外,还有别的源地,我们没有发现,也许在国外还有;另一个问题,也许是因为他们防疫措施不到位。”

(曾光教授判断,病毒源头不排除来自国外的可能性。来源:中新视频)

新冠病毒的来源,已经成了一个“烫手的山芋”,它到底来自哪里,我们一起来看看。

新冠病毒源自哪里?

3月30日,剑桥大学研究人员在《美国科学院院刊》(PANS)以“Contributed”( 注:Contributed的一种机制,即可通过院士内推发表论文。)的形式发表了一篇针对病毒溯源的研究,他们发现全球的新冠病毒已经变异为A、B、C三种类型,并且这三种类型的病毒在全球分布范围各不相同[1]。

(英国剑桥大学研究人员关于新冠病毒进化的研究快速发表。来源:PNAS官网)

仔细看来,这篇论文沿用了中国武汉病毒研究所石正丽团队发现的BatCovRaTG13病毒[2](即新冠病毒在动物中的”祖先”)作为源头,从“全球共享流感数据倡议组织”(GISAID)中提取了160个世界各地的新冠病毒组成了系统进化网络。

(通过全球不同地区来源新冠病毒基因组做出的进化树。来源:剑桥团队研究[1])

A群新冠病毒,是在人类社会里传播的最原始的病毒,上图可以看出:A群在中国、东亚、美国、澳大利亚、欧洲均有分布。

这项进化分析研究的作者将A群分为了两个亚群:

T-等位基因亚群中,有4个中国人(来自中国广东省)带有祖先基因组,而3名日本人和两名美国病人则有许多突变,据报道,这些美国患者有曾在武汉疑似疫情暴发地的居住史;

C-等位基因亚群,其中包括来自武汉的5个人(有两个携带祖先基因),另外8个来自中国其他地区和邻近国家的东亚人,该亚群有近一半(15/33)主要位于美国和澳大利亚。

(剑桥新冠病毒进化研究对病毒起源的分析。来源:剑桥团队研究[1])

B群新冠病毒,被认为是通过A群突变而来,分布以亚洲为主(93个里面占74个),中国武汉22例,东部其他地区31例。较早的B群完全在东亚传播(共26个),但是亚洲以外的每个B群都进化出了突变(共19个),作者认为这种现象可能不是因为B群在中国传播而自然发生的突变导致的,而是因为B群本身适应了亚洲人群,需要再次突变以适应欧美人群。

而C群冠状病毒被认为是B群突变而来,在中国大陆不存在,主要在欧洲分布(11例),新加坡有5例,中国香港、中国台湾和韩国也有。

该论文作者还讨论了病毒在欧美的传播链条:

巴西的第一例病人是访问意大利后感染的,其病毒属于C群;

墨西哥的病毒也是意大利起源的,是2020年2月28日在墨西哥的意大利旅行者身上被检测出来;

意大利的病毒源头是德国,一位在慕尼黑Webasto公司工作的员工。

结合上述信息,这篇论文本身并没有回复大家都关心的问题“新冠病毒是起源于美国,还是中国”。

据悉,作者已经更新了他们的样本至1000例,但目前尚未通过同行评议发表出来。

而后,论文作者Peter Forster博士接受了环球时报耿直哥采访表示[3],不论是哪篇论文,目前仍无法就病毒的来源地给出一个明确的答案。

他对A族群的分布问题,也做出了回应:

“为何A型病毒并没有在武汉和中国大范围地出现,这可能是因为A型并不适应当地人的免疫系统,所以才变异成了B型。但也可能是因为,武汉当地更多的病例是由B型感染者传染出去的,即遗传学上的“奠基者效应”(founder effect)。”

至于A型为何更多出现在美国和澳大利亚,他认为这有可能是因为A型更适应那里人的免疫系统。

但是,A型在武汉出现过,感染过一些武汉人,也感染过有武汉居住旅行史的美国人。

所以,从现有证据来看,美国的A型病毒仍然可能是从武汉居住史这个途径过去的。而并不是有些人猜测的“起源于美国”。

(Peter Forster博士回应耿直哥采访原文。来源:环球时报评论[3])

“病毒源自美国”真的实锤了吗?

事实上,关于病毒的起源,我国的学者也发布过不少论文,剑桥大学这篇研究几乎是在重复我国学者的工作。正如欧美的防疫,一步步验证了我国已经验证过的问题(比如戴口罩、加强隔离等)。

2月21日,国内的预印本网站ChinaXiv上曾发表过一篇论文,也是将新冠病毒分为了三个族群。

(国内学者2月份发表的新冠病毒进化传播研究。来源:ChinaXiv[4])

当时,这篇论文主要的热点集中在破除了“病毒源自华南海鲜市场”的认知,但我们仔细阅读下来就会发现,剑桥大学的研究几乎和该论文如出一辙。

(国内学者2月份新冠病毒进化传播研究里的全球分布地图。来源:ChinaXiv[4])

可以看到,同样的有A、B、C三个族群,不过我国学者是以B群为最早期的病毒群;

而后来我国学者这篇论文,被台湾某节目引用论述是否源自美国而大火,腾讯医典此前也曾专门做过解读:

美国虽然有更多的病毒种类,但是基本上都与中国患者有关:患者要么到过中国,要么在中国以外的国家接触过中国的患者。

(美国确诊病例分布和溯源。来源:美国CDC[5])

因此,分析了这么多,源头到底是哪儿?目前暂未可知。

不过,从越来越多的研究追溯发现,中间宿主可能是分布在东南亚国家的马来西亚穿山甲,病毒的起源可能不是中国。

寻找真正的源头是科学问题,也是让类似的疫情不会再次上演的重要因素,我们就让子弹再继续飞一会吧。

参考文献

[1] Peter Forster, Lucy Forster, Colin Renfrew, et al. Phylogenetic network analysis of SARS-CoV-2 genomes. PANS. 2020.

[2] Zhou P, Yang XL, Wang XG, et al. A pneumonia outbreak associated with a new coronavirus of probable bat origin. Nature. 2020, 579(7798):270-273.

[3] 环球时报新媒体. 《这篇论文,能说明“病毒并非来自中国,而是美国吗”?》

https://view.inews.qq.com/a/20200411A0627T00

[4] Yu WB, Tang GD, Zhang L, et al. Decoding evolution and transmissions of novel pneumonia coronavirus using the whole genomic data. ChinaXiv. 2020:202002.00033.

[5] https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/cases-in-us.html

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